La partícula は tras "expresión de lugar に"presenta la situación o la existencia como tópico de la oración. Hablando de~: en lo referente a ~.
きょうとには 古い お寺が たくさん あります。
Hablando de Kioto(TL) alla hay muchos templos budistas.
大学には りゅう学生が おおぜい います。
Hablando de la universidad (TL) / hay muchos estudiantes internacionales.
Lesson 6-1-2「はこの 中に りんごが あります。」
Hay manzanas en/dentro de la caja.